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文學院
中國文學系碩士班外國語文學系碩士班(甲組乙組哲學研究所碩士班
劇場藝術學系碩士班音樂學系碩士班 
理學院
生物科學系碩士班(甲組乙組化學系碩士班物理學系碩士班(甲組乙組
應用數學系碩士班(甲組乙組丙組丁組生物醫學研究所碩士班醫學科技研究所
工學院
電機工程學系碩士班
甲組乙組丙組丁組戊組己組
環境工程研究所碩士班資訊工程學系碩士班(甲組乙組
光電工程學系碩士班通訊工程研究所碩士班(甲組乙組機械與機電工程學系碩士班
甲組乙組丙組丁組戊組
材料與光電科學學系碩士班資訊工程學系資訊安全碩士班 
管理學院
企業管理學系企業管理碩士班甲班資訊管理學系碩士班財務管理學系碩士班
公共事務管理研究所碩士班人力資源管理研究所碩士班(甲組乙組行銷傳播管理研究所碩士班(甲組乙組
企業管理學系企業管理碩士班乙班企業管理學系醫務管理碩士班國際經營管理碩士學程
海洋科學學院
海洋生物科技暨資源學系碩士班(甲組乙組丙組海下科技研究所碩士班海洋事務研究所碩士班
海洋科學系碩士班(甲組乙組海洋環境及工程學系碩士班(甲組乙組丙組丁組 
社會科學院
中國與亞太區域研究所碩士班(甲組乙組丙組政治學研究所碩士班經濟學研究所碩士班
教育研究所碩士班社會學系碩士班